مرکز فناوری اطلاعات دانشگاه به عنوان یکی از مراکز ستادی واقع در تشکیلات ریاست دانشگاه و مشتمل بر ادارات/گروه‌های فناوری اطلاعات، تحقیق و توسعه فناوری اطلاعات، زیرساخت و شبکه و همچنین آمار و تحلیل، متولی کلیه جنبه‌های مرتبط با حوزه فناوری اطلاعات در دانشگاه می‌باشد که برخورداری از توانمندترین و مجرب‌ترین کارشناسان رشته‌های مختلف حوزه فناوری اطلاعات و تعلق یکی از بزرگ‌ترین مراکز داده به آن در میان واحدهای تابعه وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، جایگاهی ممتاز و متمایز به آن بخشیده است.